分子蒸餾是一種特殊的液--液分離技術(shù)，它不同于傳統(tǒng)蒸餾依靠沸點(diǎn)差分離原理，而是靠不同物質(zhì)分子運(yùn)動平均自 由程的差別實(shí)現(xiàn)分離。

當(dāng)液體混合物沿加熱板流動并被加熱，輕、重分子會逸出液面而進(jìn)入氣相，由于輕、重分子的自由程不同，因此，不同物質(zhì)的分子從液面逸出后移動距離不同，若能恰當(dāng)?shù)卦O(shè)置一塊冷凝板，則輕分子達(dá)到冷凝板被冷凝排出，而重分子達(dá)不到冷凝板沿混合液排出。這樣，達(dá)到物質(zhì)分離的目的。
　　在沸騰的薄膜和冷凝面之間的壓差是蒸汽流向的驅(qū)動力，對于微小的壓力降就會引起蒸汽的流動。在1mbar下運(yùn)行要求在沸騰面和冷凝面之間非常短的距離，基于這個(gè)原理制作的蒸餾器稱為短程蒸餾器。短程蒸餾器（分子蒸餾）有一個(gè)內(nèi)置冷凝器在加熱面的對面，并使操作壓力降到0.001mbar。

短程蒸餾器是一個(gè)工作在1~0.001mbar壓力下熱分離技術(shù)過程，它較低的沸騰溫度，非常適合熱敏性、高沸點(diǎn)物。其基本構(gòu)成：帶有加熱夾套的圓柱型筒體，轉(zhuǎn)子和內(nèi)置冷凝器；在轉(zhuǎn)子的固定架上裝有刮膜器和防飛濺裝置。內(nèi)置冷凝器位于蒸發(fā)器的中心，轉(zhuǎn)子在圓柱型筒體和冷凝器之間旋轉(zhuǎn)。
　　短程蒸餾器由外加熱的垂直圓筒體、位于它的中心冷凝器及在蒸餾器和冷凝器之間旋轉(zhuǎn)的刮膜器組成。
在實(shí)際的工業(yè)化應(yīng)用中較常規(guī)蒸餾技術(shù)具有以下明顯的優(yōu)勢。對于高沸點(diǎn)、熱敏性及易氧化物料的分離, 分子蒸餾提供了*分離方法。因?yàn)榉肿诱麴s是在很低溫度下操作, 且受熱時(shí)間很短; 分子蒸餾可極有效地脫除液體中的低分子物質(zhì)（如有機(jī)溶劑、臭味等）, 這對于采用溶劑萃取后液體的脫溶是非常有效的方法; 分子蒸餾可有選擇的蒸出目的產(chǎn)物, 去除其他雜質(zhì), 通過多級分離可同時(shí)分離兩種以上的物質(zhì); 分子蒸餾的分離過程是物理過程, 因而可很好地保護(hù)被分離物質(zhì)不受污染和侵害。隨著工業(yè)化的發(fā)展, 分子蒸餾技術(shù)已廣泛應(yīng)用于高附加值物質(zhì)的分離, 特別是天然物的分離, 因而被稱為天然品質(zhì)的保護(hù)者和回歸者。